平成23年度第三回ワークショップ
提供: Ncube
第三回ワークショップ
- 日時: 平成23年 6月 7日(火) 午後1時00分~5時30分
- 場所: 名古屋大学大学院情報科学研究科 (4階院生室)
<<プログラム>>
- 13:00-13:10 : はじめに
- 13:10-13:40 : 麻田俊雄 (大阪府立大学)
- "効率的なQM/MM FEG最適化の検討 その10 ~一括QM計算の最適化への適用~" 資料
- 13:40-14:10 : 小谷野哲之(名古屋大学)
- "FMO計算プログラムPAICSとAMBER/PAICSインターフェースの紹介" 資料
- 14:10-14:40 : 竹中規雄(名古屋大学)
- "Adaptive QM/MM-MD法の凝集反応系への適用 その3 ~FMO/MM-MD法への拡張とそのテスト計算結果~" 資料
- 14:40-15:10 : 山本典史・古賀伸明(名古屋大学)
- "フェントン反応の分子機構:自由エネルギー変化の解析(4)~成分分析の再考~" 資料
- 15:10-15:20 : 休憩
- 15:20-15:50 : 山田健太・古賀伸明(名古屋大学)
- "電荷割り当て法(CHIEF法)の展開 その13 ~イメージセルのQM領域からの静電的効果に関する考察:QM/MM-Ewald法との比較検討およびHF法とDFT法への適用結果について・再考~" 資料
- 15:50-16:20 : 栗崎以久男(名古屋大学)
- "タンパク質のアロステリック構造変化を引き起こすホットスポットの同定:分子間相互作用の有無による分子運動ダイナミクスの比較" 資料
- 16:20-16:50 : 岡本拓也 (名古屋大学)
- "溶媒の粗視化1~粗視化の手続き~" 資料
- 16:50-17:20 : 高柳昌芳(名古屋大学)
- "外部計算機センターへのMDジョブ投入手順2:NESASへの実装" 資料
- 17:20-17:30 : おわりに