平成23年度第七回ワークショップ

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第七回ワークショップ


  • 日時: 平成23年 11月 29日(火) 午後1時00分~6時10分
  • 場所: 名古屋大学大学院情報科学研究科 (8階演習室)


                  <<プログラム>>

  1. 13:00-13:10  : はじめに
  2. 13:10-13:40  : 麻田俊雄 (大阪府立大学)
    • "力場の自動作成ルーチンの開発 その3 ~ 水の非結合性相互作用パラメータの決定 その2 ~"  資料
  3. 13:40-14:10 : 小谷野哲之(名古屋大学)
    • "超好熱性古細菌由来へキソキナーゼとその基質複合体の構造解析 ~糖複合体とATP複合体でのB-factorの計算~" 資料
  4. 14:10-14:40 : 竹中規雄(名古屋大学)
    • "Adaptive multiscale QM/MM-MD法の展開 その3 ~水溶液中グリシンの水和構造解析のまとめ~" 資料
  5. 14:40-14:50  : 休憩
  6. 14:50-15:20  : 山本典史・古賀伸明(名古屋大学)
    • "フェントン反応機構の自由エネルギー解析:反応経路ネットワークの考察" 資料
  7. 15:20-15:50  : 山田健太・古賀伸明(名古屋大学)
    • "電荷割り当て法(CHIEF法)の展開 その17 ~CHIEF法の適用範囲を広げる2つの方法の提案とその検討~" 資料
  8. 15:50-16:20  : 栗崎以久男(名古屋大学)
    • "タンパク質のアロステリック構造変化を引き起こすホットスポットの同定::マロン酸存在下で共同性を示すトラジェクトリーの解析" 資料
  9. 16:20-16:30  : 休憩
  10. 16:30-17:00  : 岡本拓也 (名古屋大学)
    • "溶媒の粗視化5 ~メモリカーネルの設計~" 資料
  11. 17:00-17:30  : 太田雄介(名古屋大学)
    • "AMBER-Gaussianインターフェースを用いたQM/MM-MDシミュレーションの有機金属化合物への適用:THF溶媒中におけるメチルリチウムの会合状態(16)~解離過程に沿った熱効果の評価~" 資料
  12. 17:30-18:00 :  高柳昌芳(名古屋大学)
    • "クラスタリング技法によるリガンド分布の分類1:Ward法による分類手順" 資料
  13. 18:00-18:10  : おわりに