平成２２年度第六回ワークショップ

第六回ワークショップ

• 日時：　平成２２年　１０月　５日（火）　午後１時３０分～５時４５分
• 場所：　名古屋大学大学院情報科学研究科　（３階セミナー室）

　　　　　　　　　　　　　　　　　　<<プログラム>>

1. 13:30-13:40  : はじめに
2. 13:40-14:05  : 麻田俊雄 (大阪府立大学)
   • "効率的なFEG最適化の検討　その４　　～ CRKのFEG-NEB最適化への適用２ ～" 　資料
3. 14:05-14:30  : 太田雄介 (名古屋大学）
   • "AMBER-Gaussianインターフェースを用いたQM/MM-MDシミュレーションの有機金属化合物への適用：ＴＨＦ溶媒中におけるメチルリチウムの会合状態（６）-THF中メチルリチウム四量体の解離自由エネルギー計算３-" 資料
4. 14:30-14:55  : 小谷野哲之（名古屋大学）
   • "NESASへのFEG-NEB法の実装に向けて"　資料
5. 14:55-15:20  : 優乙石（青山学院大学）
   • "水分子配置情報からの蛋白質部分モル体積再構成：その開発と応用" 資料
6. 15:20-15:30  : 休憩
7. 15:30-15:55  : 高柳昌芳 (名古屋大学）
   • "Hadoopによる多並列MD解析環境の構築　～AMBER出力ファイルフォーマットの検討～" 資料
8. 15:55-16:20  : 岡本拓也 (名古屋大学)
   • "AMBER-PAICS interface開発２　～full QM版完成～" 資料
9. 16:20-16:45  : 山田健太・古賀伸明（名古屋大学）
   • "電荷割り当て法（CHIEF法）の展開　その６　～イメージセルのQM領域からの静電的効果に関する考察：PM3法に対するMINPA法の詳細と結果～" 資料
10. 16:45-17:10　: 　山本典史・古賀伸明（名古屋大学）
    • "金属結合ペプチドの触媒反応機構についてのマルチスケールシミュレーションを基盤とした理論的解析：酸化還元過程の量子化学計算" 資料1 資料2
11. 17:10-17:35　: 竹中規雄 (名古屋大学)
    • "QM/MM-MDシミュレーションの高精度化 その3　～OE-MD法へのスムージングアルゴリズムの実装～" 資料
12. 17:20-17:30  : おわりに