平成２１年度第五回ワークショップ

第五回ワークショップ

• 日時：　平成２１年　９月　１日（火）　午後１時３０分～５時３０分
• 場所：　名古屋大学大学院情報科学研究科　６１６室（６階）

　　　　　　　　　　　　　　　　　　<<プログラム>>

1. 13:30-13:40  : はじめに
2. 13:40-14:10  : 麻田俊雄 (大阪府立大学)
   • "FEG-NEB最適化のAMBER9への実装　その４ ～並列化とタンパク質への適用～" 　資料
3. 14:10-14:40  : 竹中規雄 (名古屋大学)
   • "ONIOM-EE-MD法のプログラム開発　その３ ～アルゴリズムの修正と溶質に対する溶媒のQM分極効果の調査～" 資料
4. 14:40-15:10  : 岡本拓也 (名古屋大学)
   • "Gaussian Interface リリースに向けて その６～我々の方法とPUPILによる方法との比較～" 資料
5. 15:10-15:40  : 小谷野哲之（名古屋大学）
   • "並行MD解析システムへのFEG法の実装に向けた調査　その２ ～FEG計算における溶質の並進・回転の考慮について～" 資料
6. 15:40-15:50  : 休憩
7. 15:50-16:20  : 山田健太・古賀伸明（名古屋大学）
   • "Amber9とGaussian03のインターフェイスの開発　その８　～QM-Ewald法の代替としてのFennellポテンシャルの検討、および、インターフェイスへの組み込み～"　 資料
8. 16:20-16:50  : 高柳昌芳 (名古屋大学）
   • "Hadoop Streaming による並列ＭＤ計算実行手順～"　 資料
9. 16:50-17:20  : 太田雄介・竹中規雄(?) (名古屋大学）
   • "Semi-empirical QM/MDシミュレーションのプログラム開発　その３～孤立分子系に対するMOPAC2009-AMBER9インターフェース（試作版）の作成～" 資料
10. 17:20-17:30  : おわりに