平成21年度第四回ワークショップ
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第四回ワークショップ
- 日時: 平成21年 7月 14日(火) 午後1時30分~5時30分
- 場所: 名古屋大学大学院情報科学研究科 616室(6階)
<<プログラム>>
- 13:30-13:40 : はじめに
- 13:40-14:10 : 麻田俊雄 (大阪府立大学)
- "FEG-NEB最適化のAMBER9への実装 その3 ~NEB計算の実装~" [[Media:|資料1]] [[Media:|資料2]]
- 14:10-14:40 : 竹中規雄 (名古屋大学)
- "ONIOM-EE-MD法のプログラム開発 その2 ~3レイヤーONIOM-EE-MD法のアルゴリズムの検討~" [[Media:|資料]]
- 14:40-15:10 : 岡本拓也 (名古屋大学)
- "アンサンブルMD法による化学反応に実現 その1~概要とその計算可能性~" [[Media:|資料]]
- 15:10-15:40 : 小谷野哲之(名古屋大学)
- "並行MD解析システムへのFEG法の実装に向けた調査 その1 ~平衡サンプリング方法について~" [[Media:|資料]]
- 15:40-15:50 : 休憩
- 15:50-16:20 : 山田健太・古賀伸明(名古屋大学)
- "Amber9とGaussian03のインターフェイスの開発 その7 ~インターフェイスの機能追加を目的とした、Funnellポテンシャルの調査~" [[Media:|資料]]
- 16:20-16:50 : 高柳昌芳 (名古屋大学)
- "超多並列MD計算によるタンパク質構造ダイナミクス解明に向けた検討
~ヘモグロビン4次構造変形~" [[Media:|資料1]]
- 16:50-17:20 : 太田雄介・竹中規雄(?) (名古屋大学)
- "Semi-empirical QM/MDシミュレーションのプログラム開発 その2~MOPAC2009-AMBER9インターフェースのアルゴリズムの具体的検討~" [[Media:|資料]]
- 17:20-17:30 : おわりに