「平成21年度第二回ワークショップ」の版間の差分

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#*"SanderのQM/MM計算における静電相互作用(Ewald)の扱いについて"  [[Media:|資料]]
 
#*"SanderのQM/MM計算における静電相互作用(Ewald)の扱いについて"  [[Media:|資料]]
 
# 14:10-14:40  :  竹中規雄 (名古屋大学)
 
# 14:10-14:40  :  竹中規雄 (名古屋大学)
#*"高速なQM/MM-MDシミュレーションの実現に向けて その2: ~NollsPM3の参照データ作成の自動化~"  [[Media:|資料]]
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#*"高速なQM/MM-MDシミュレーションの実現に向けて その2: ~NollsPM3の参照データ作成の自動化~"  [[Media:第二回CREST-JSTワークショップ_takenaka.ppt|資料]]
 
# 14:40-15:10  :  岡本拓也 (名古屋大学)
 
# 14:40-15:10  :  岡本拓也 (名古屋大学)
#*"アンサンブルMDの実現方法"  [[Media:|資料]]
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#*"アンサンブルMDの実現方法"  [[Media:wpp資料20090423_okamoto.ppt|資料]]
 
# 15:10-15:40  :  小谷野哲之(名古屋大学)  
 
# 15:10-15:40  :  小谷野哲之(名古屋大学)  
#*"SANDERへの自由エネルギー勾配法の実装 その5  ~FEG法の実装に伴うソースコード変更点について~" [[Media:|資料]]
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#*"SANDERへの自由エネルギー勾配法の実装 その5  ~FEG法の実装に伴うソースコード変更点について~" [[Media:CREST090512_koyano.ppt|資料]]
 
# 15:40-15:50  :  休憩
 
# 15:40-15:50  :  休憩
 
# 15:50-16:20  :  山田健太・古賀伸明(名古屋大学)
 
# 15:50-16:20  :  山田健太・古賀伸明(名古屋大学)
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#*"次世代並列MD計算システム開発へ向けた調査 その1 ~並列分散処理システムHadoop" [[Media:|資料]]
 
#*"次世代並列MD計算システム開発へ向けた調査 その1 ~並列分散処理システムHadoop" [[Media:|資料]]
 
# 16:50-17:20  :  太田雄介 (名古屋大学)
 
# 16:50-17:20  :  太田雄介 (名古屋大学)
#*"3レイヤーQM/MM-MD法のプログラム開発 その1  ~ONIOM-MD法の実現可能性に関する検討~" [[Media:|資料]]
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#*"3レイヤーQM/MM-MD法のプログラム開発 その1  ~ONIOM-MD法の実現可能性に関する検討~" [[Media:H21第2回CRESTワークショップOhta090512.ppt|資料]]
 
# 17:20-17:30  :  おわりに
 
# 17:20-17:30  :  おわりに

2009年5月13日 (水) 05:06時点における版

第二回ワークショップ


  • 日時: 平成21年 5月 12日(火) 午後1時30分~5時30分
  • 場所: 名古屋大学大学院情報科学研究科 616室(6階)


                  <<プログラム>>

  1. 13:30-13:40  : はじめに
  2. 13:40-14:10  : 麻田俊雄 (大阪府立大学)
    • "SanderのQM/MM計算における静電相互作用(Ewald)の扱いについて"  [[Media:|資料]]
  3. 14:10-14:40  : 竹中規雄 (名古屋大学)
    • "高速なQM/MM-MDシミュレーションの実現に向けて その2: ~NollsPM3の参照データ作成の自動化~" 資料
  4. 14:40-15:10  : 岡本拓也 (名古屋大学)
    • "アンサンブルMDの実現方法" 資料
  5. 15:10-15:40  : 小谷野哲之(名古屋大学)
    • "SANDERへの自由エネルギー勾配法の実装 その5 ~FEG法の実装に伴うソースコード変更点について~" 資料
  6. 15:40-15:50  : 休憩
  7. 15:50-16:20  : 山田健太・古賀伸明(名古屋大学)
    • "Amber9とGaussian03のインターフェイスの開発 その5 ~ソース公開を目的としたコード変更点、及び、結果の再確認について~"  [[Media:|資料]]
  8. 16:20-16:50  : 高柳昌芳 (名古屋大学)
    • "次世代並列MD計算システム開発へ向けた調査 その1 ~並列分散処理システムHadoop" [[Media:|資料]]
  9. 16:50-17:20  : 太田雄介 (名古屋大学)
    • "3レイヤーQM/MM-MD法のプログラム開発 その1 ~ONIOM-MD法の実現可能性に関する検討~" 資料
  10. 17:20-17:30  : おわりに