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Ncube各プロジェクトの内容をまとめるページです。

数式の書き方はWikipediaの項目を参照してください。

ROAR-GAUSSIAN（仮称）

ab initio分子軌道法を利用した分子動力学法を開発します。 現在は、AMBER7のROAR 2.1にGAUSSIAN03を接続することを目指しています。

非平衡状態解析システム（仮称）

系の一部を切り出した多数の初期構造を用いて、並行して分子動力学計算を行い、それらのトラジェクトリからさまざまな統計量を算出するプログラムを作成します。

以下のテストは、そのうち消えます。

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MediaWikiが正常にインストールされました。

<math> s_k \equiv 0 \pmod{m} n\ \bmod M = r</math>

<math>\int_{-N}^{N} e^x\, dx</math>

<math>A \xleftarrow{n+\mu-1} B\xrightarrow[T]{n\pm i-1} C</math>

<math>\oint_{C} x^3\, dx + 4y^2\, dy</math>

<math>\begin{cases}

   3x + 5y +  z = 1\\
   7x - 2y + 4z = 2\\
  -6x + 3y + 2z = 3

\end{cases}</math>

<math>\phi_n(\kappa)

= \frac{1}{4\pi^2\kappa^2} \int_0^\infty
\frac{\sin(\kappa R)}{\kappa R}
\frac{\partial}{\partial R}
\left[R^2\frac{\partial D_n(R)}{\partial R}\right]\,dR</math>

<math>{}_pF_q(a_1,...,a_p;c_1,...,c_q;z)

= \sum_{n=0}^\infty
\frac{(a_1)_n\cdot\cdot\cdot(a_p)_n}{(c_1)_n\cdot\cdot\cdot(c_q)_n}
\frac{z^n}{n!}</math>

<math> E=mc^2 </math>

Introduction

The theory of Brownian motion in an homogeneous fluid is discussed with in the framework of the method for the construction of the distribution function for a nonequilibrium system.

Hamiltonian

We consider in the framework of classical mechanics the system of Brownian particles and fluid with the Hamiltonian

<math>\mathcal{H} = \mathcal{H}_1 + \mathcal{H}_2</math>

with

<math>\mathcal{H}_1 = \sum_\alpha \left[ \frac{\mathbf{P}_\alpha^2}{2M} + \sum_q V(|\mathbf{R}_\alpha-\mathbf{r}_q|) \right]</math>

and

<math>\mathcal{H}_2 = \sum_i \left[ \frac{\mathbf{p}_i^2}{2m} + \sum_{f(<i)} V(|\mathbf{r}_i-\mathbf{r}_j|) \right]</math>

where<math>\mathbf{P}_\alpha</math>, <math>\mathbf{R}_\alpha</math>, <math>M</math>, <math>\mathbf{p}_i</math>, <math>\mathbf{r}_i</math> and <math>m</math> and the momentum, position and mass of the <math>\alpha</math>-th Brownian particle and the <math>i</math>-th fluid particle respectively; <math>V(|\mathbf{R}_\alpha-\mathbf{r}_i|)</math> is the interaction potential of the Brownian particle with the fluid particle; <math>u(|\mathbf{r}_i-\mathbf{r}_j|)</math> is the interaction energy of two fluid particles.

Symbol

Symbol	Meaning
<math>\mathcal{H}</math>	Hamiltonian